La Facultad de Ciencias Químicas está ubicada en el Campus Universitario de San Lorenzo, al que se accede tanto por la ruta Mariscal Estigarribia a la altura del Km. 11 como por la prolongación de la Avenida Mariscal López antes de la entrada a la Ciudad de San Lorenzo.
El Campus congrega la mayor parte de las Unidades Académicas componentes de la Universidad Nacional de Asunción. La Facultad de Ciencias Químicas ocupa en el Campus un predio de 62.060 m2 de superficie, donde tiene distribuidas sus diversas dependencias: oficinas administrativas, aulas, laboratorios, plantas piloto, dependencias de apoyo tales como biblioteca, sala de computación, sala de estudio, comedor universitario, área de mantenimiento, depósitos, caminos internos, playas de estacionamiento, jardines y campos de experimentación.